分子蒸馏是一种特殊的液体分离技术，它不同于传统的基于沸点差分离原理的蒸馏，而是基于不同物质分子运动平均自由程的差异来实现分离。分子蒸馏是一种在高真空下操作的蒸馏方法。蒸气分子的平均自由程大于蒸发面与冷凝面之间的距离，因此可利用料液中各组分蒸发速率的差异来分离混合液。
传统蒸馏是依靠不同物质沸点的差异进行分离，因此很难分离出某些在沸点温度下容易氧化、分解或聚合的物质。
分子蒸馏的分离功能是利用液体分子在受热时从液面逸出，不同类型分子逸出后的平均运动自由程不同，进行物质分离。
混合液体沿加热板流下。加热后，轻分子和重分子都逃逸到气相中。由于轻分子和重分子的自由程不同，轻分子的自由程大，可以到达板式聚光器，冷凝后沿着聚光器的板向下走。流动时，重分子的自由程小，不能到达凝结面而饱和于气相，又回到液相，沿加热板向下流动，从而形成轻重分子的分裂分离。
分子蒸馏具有操作真空度高、加热温度低、加热时间短、分离度高等特点，特别适用于高沸点、热敏性和易氧化物质的分离。
与传统蒸馏相比，分子蒸馏具有明显的技术经济优势：
1、产品质量高。由于分子蒸馏的操作温度低、加热时间短，可以获得纯度高、原始质量好的产品，这对天然物质尤为重要。
2、产品成本低。由于分子蒸馏分离效率高，产品收率高，可大大降低生产成本。
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