实验室分子蒸馏在进行运用时其剩余气体的分压必需要很低，这样就会使得剩余气体的平均自由程长度是蒸馏器和冷凝器外表之间间隔的倍数，分子蒸馏在饱和压力下，其蒸汽分子的平均自由程长度有必要和蒸腾器以及冷凝器外表之间的间隔具有相同的数量级。
分子蒸馏在蒸腾没有其任何的妨碍的情况下，能够有用的从剩余气体分子中产生，设备中一切的蒸汽分子在没有遇到其它分子和回来到液体的进程中抵达冷凝器外表，其蒸腾速度在所在的温度下到达或许的值。蒸腾速度与压力成正比，因此，分子蒸馏的馏出液量相对比较小。
分子蒸馏在大中型短程蒸馏设备中，其冷凝器和加热外表之间的间隔约为20~50mm，剩余气体的压力为10-3mbar时，剩余气体分子的平均自由程长度约为2倍长。短程蒸馏器*能满意分子蒸馏的一切必要条件。
实验室分子蒸馏在沸点温度下进行别离，设备在任何温度下进行，在运用的进程中只需冷热双面间存在着温度差，这样就能到达别离的意图，液相和气相间能够构成相平衡状况;而分子蒸馏进程中，从蒸腾外表逸出的分子直接飞射到冷凝面上，中心不与其它分子产生磕碰，理论上没有回来蒸腾面的或许性，所以，分子蒸馏进程是不可逆的。
实验室分子蒸馏通常情况下，液相中的分散速度是操控分子蒸馏速度的主要要素，所以在进行运用的进程中应该尽量减薄液层厚度及强化液层的活动。蒸腾速度跟着温度的升高而上升，但别离要素有时却跟着温度的升高而下降，所以，应以被加工物质的热稳定性为条件，挑选经济合理的蒸馏温度。
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